生物柴油主要指脂肪酸甲酯，它即可以用作燃料，也可以用作化工产品的原料或中间体，比如用作工业溶剂，或用来制备表面活性剂等。
燃料
生物柴油的主要用途是作为清洁石油柴油的调和组分和生产满足欧Ⅲ标准的清洁柴油。与石油柴油比较，生物柴油具有十六烷值高、硫含量低、不含芳烃、闪点高、润滑性能好、生物降解快等优点。在国外，生物柴油作为燃料的主要品种及用途包括：
（1）100%生物柴油。这对原料与产品均有严格要求，如德国采用低芥酸、低硫甙的菜籽油生产，产品可满足欧Ⅲ排放要求。欧洲多个国家和美国都有100％生物柴油的标准，表1.1中给出了美国生物柴油的标准(ASTM D6751-03)。
（2）生物柴油与石油柴油调配使用。国外常用的生物柴油调配量是2％、5%、10%、20%、30％等，分别称为B2、B5、B10、B20和B30柴油。在B2柴油中生物柴油的作用是提高柴油的润滑性。较高含量的生物柴油有利于降低有害气体的排放，保护环境。目前，国外没有为这种调配的柴油单独制定标准，只要100％生物柴油符合相应的标准即可，比如美国就规定生物柴油必须达到ASTM D6751的标准才能作为柴油调和组分使用。
（3）家庭加热炉燃料。在国内，生物柴油很少用做燃料，其中的一个主要原因是国家还没有颁布相关标准，目前石油化工科学研究院正在制定中。另外，各个生物柴油生产厂家一般都有自己的企业标准，如福建卓越新能源发展公司制定的标准Q/LYZY01－2002。
